纪念碑谷箱子关卡需依次激活箱子四角的四个按钮，进入对应空间点亮四座灯塔，再触发后续机关引导艾达通关，核心是利用空间切换与乌鸦人协作破解机关。
进入关卡后，眼前是一个封闭的正方体箱子，四角各有一个凸起的圆形按钮，每个按钮对应一个独立的解谜空间。首先点击箱子右上角的按钮，打开青色空间，主角艾达会出现在场景中，操控艾达走到灰色按钮上踩下，点亮南侧的青色灯塔，接着沿楼梯走进北侧的门，返回箱子顶部后，再次点击右上角按钮关闭该空间。随后打开箱子左下角的按钮，进入黄色空间，这里没有艾达，只有可升降的平台与乌鸦人，先拉动平台上的凸起机关，调整平台高度让乌鸦人顺利走到下方平台，再降下顶部平台与乌鸦人所在位置对齐，等待乌鸦人走上顶部平台后，将平台升至与按钮平齐，让乌鸦人踩下按钮，点亮北侧的黄色灯塔，完成后关闭该空间。
接着打开箱子左上角的按钮，进入紫色空间，场景内有延伸的路径与机关，操控艾达沿路径移动，踩下场景中的机关按钮，点亮西侧的紫色灯塔，再从对应的门返回箱子顶部，关闭这个空间。最后打开箱子右下角的按钮，进入绿色空间，此空间右侧有长条滑动机关，没有艾达只有乌鸦人，反复滑动长条机关，调整机关位置为乌鸦人铺好通路，让乌鸦人逐步移动到机关按钮处并踩下，成功点亮东侧的绿色灯塔，至此四座灯塔全部亮起。
四座灯塔全亮后，箱子左侧会出现一个新的总开关，点击这个开关，箱子右侧的长滑块会被激活，滑动该滑块可拼接出全新的通道，艾达会重新出现在箱子外侧。此时操控艾达沿新通道走进下方的小门，依次踩动场景内出现的多个机关按钮，每踩下一个按钮就会解锁新的楼梯或路径，逐步推进到场景深处，最终走到祭坛位置，完成整个箱子关卡的挑战。
