阵法的合理运用是提升战斗效率的核心策略之一。玩家需要根据自身队伍配置和怪物特性灵活选择，常见的有防御型阵法如地载阵和输出型阵法如虎阵，这些阵法能通过调整伙伴站位和属性加成来应对不同挑战，例如在低层关卡可以挂机通过，但高层则需要更精细的阵法配合以应对高伤害或特殊技能。
防御性阵法如地载阵在秘境降妖中扮演着重要角色，尤其适合怪物攻击力较高的场景。它能有效提升队伍的生存能力，让辅助伙伴站在防御位吸收伤害，同时输出伙伴可以稳定发挥；这种阵法特别适用于辅助系伙伴较多的队伍，帮助在持久战中保持稳定。
输出型阵法如虎阵则更侧重快速击杀敌人，适合法伤或物理伤害较高的玩家搭配群秒类伙伴使用，能显著缩短战斗回合数并降低风险。根据玩家的人物属性，法伤偏高时推荐搭配法术加成阵法，而物理偏高时则更适合物理输出阵法，这样可以最大化伤害效益。
阵法的选择还需结合技能释放顺序和伙伴特性进行优化，例如人物1速带风袋时，技能顺序可按增伤、群秒、单法等方式排列，以发挥阵法的最大潜力。在面对高难度关卡时，阵法调整往往需要根据怪物类型进行，例如在物免高的层数选择法系阵法，或在男性伙伴增伤关卡调整阵容以利用加成效果。秘境降妖中不同层数的怪物特点各异，例如有些主怪会释放减伤护盾或回血技能，此时选用带有驱散或控制效果的伙伴配合相应阵法能更轻松应对。
