飞船的启动需要玩家完成一系列关键步骤，包括收集能量块、解开冷冻舱密码以及调整飞船仪表。首先需要进入飞船内部，飞船门上的密码可以在工厂左边的屋子找到，密码图案与外星人尸体脚部对应的图案一致，该图案为随机生成。进入飞船后，在二楼将异形块放入密封罐中获得花，同时打开水箱放水。冷冻舱内有一名被冰封的宇航员，需要解开八根条状物的密码门才能唤醒他，密码机制与游戏太阳纪类似，需将对应颜色的圆圈与方块对齐。
关键道具蓝色能量块的获取需要通过时空穿越完成。回到过去将种子交给少年种植，返回现代后种子已长成大树，攀爬进入飞船。在工厂左侧房间用绿色药水复活外星人，获得物品组合提示。按照提示在右侧房间摆放鹿角、贝壳、白羽毛、鱼骨和花，放入符石后得到金色石饼。回到过去神庙密室，放入金色石饼并根据岛上石像的姿势解开机关，最终获得蓝色能量块。能量块是启动飞船的核心物品，需将其投入飞船的能量槽中。
飞船驾驶室的仪表调整是飞行的最后一步。密码来源于游戏中宇航员雕塑的投影，需按照特定顺序拨动六枚时钟状物品。若处于二周目，则需参考两处笔记记录的顺序，通常以时刻表为基准，如7、12、5、10、1、9等数字组合。调整完毕后，飞船将破开玻璃罩飞向天空。此过程中需注意，一周目可直接按照雕塑影像调整，二周目则需要结合更多线索。
整个流程涉及多个场景的联动解谜，包括现代工厂、古代神庙和飞船内部。玩家需要在不同时空之间穿梭，收集关键物品并破解机关。飞船启动后，游戏主线剧情即告完成。该结局设计体现了游戏时间的灰烬的核心主题，通过时空交错的方式将谜题与叙事紧密结合。完成所有步骤后，飞船将成功升空，玩家可继续探索二周目新增内容。
